Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2743432	2743478	47	23 [0]	[1] 25	trmD	tRNA (guanine‑1‑)‑methyltransferase

TCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCC  >  W3110S.gb/2743368‑2743431                                                                | tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGTAACTTCCATccc  <  1:1347599/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1084048/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:997291/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:728358/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:727451/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:291108/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:2540174/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:2390660/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:2365516/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:2362927/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1964833/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1885268/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1419437/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1329440/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:132758/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1286040/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1281107/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1002619/64‑1 (MQ=255) tCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCAGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1294795/64‑1 (MQ=255)   aaaCGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1102247/62‑1 (MQ=255)      cGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1999049/59‑1 (MQ=255)                          aTGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:1891067/39‑1 (MQ=255)                              ttGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATccc  <  1:475971/35‑1 (MQ=255)                                                                | TCAAACGCCAGCGACGTATCTCGGCATGGTTGCCCGACAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCC  >  W3110S.gb/2743368‑2743431

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑