Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2878005	2878015	11	39 [3]	[0] 22	ygbT	conserved hypothetical protein

ACGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGCCTT  >  W3110S.gb/2877940‑2878007                                                                 |    aCGTCCATTCCTTGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:626014/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1031622/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:926338/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:918788/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:876849/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:851457/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:749040/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:655667/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:620315/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:550750/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:395061/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:377507/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:27985/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:2220232/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:2133627/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:2103144/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:2032146/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:2043242/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1277751/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1703506/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1286880/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1378304/65‑1 (MQ=255) aCGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1390972/65‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:942915/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1114196/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1278402/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:792412/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:685062/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1412526/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1655478/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1782817/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:2322916/64‑1 (MQ=255)  cGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACAGc     <  1:5439/64‑1 (MQ=255)    tccattccatGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGCCtt  <  1:1686559/65‑1 (MQ=255)     ccattccatGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGCCtt  <  1:2005935/64‑1 (MQ=255)              gTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:2311122/52‑1 (MQ=255)                     cGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:862572/45‑1 (MQ=255)                           gCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGc     <  1:1018391/39‑1 (MQ=255)                               cGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGCCtt  <  1:2180904/38‑1 (MQ=255)                                                                 |    ACGTCCATTCCATGTCACGCCGTATTGCTTCGCCAGAAGTGCGTAGGTTGCCCGCACGCGACTGCCTT  >  W3110S.gb/2877940‑2878007

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑