Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2922052	2922069	18	35 [0]	[0] 13	yqcB	tRNA pseudouridine synthase

CCAGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACCG  >  W3110S.gb/2921987‑2922051                                                                 | ccaGTCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1871941/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGTGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:542885/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2494077/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:203211/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2042128/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2096415/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2103653/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2185337/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2313216/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2445148/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1896096/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:2543180/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:36049/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:368512/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:652387/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:710492/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:715509/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:720626/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1556228/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1205680/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1231684/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:127389/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1352148/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1417969/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1457658/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:148256/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1505392/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1902026/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1573068/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1719021/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1757817/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1846501/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1864857/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1017308/65‑1 (MQ=255) ccaGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGGCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACcg  <  1:1715301/65‑1 (MQ=255)                                                                 | CCAGGCCGTAGCGCGTGGTCGGGTAACGTCCGGTCGCTACCGGCATTTCTACGGTCGCCAGACCG  >  W3110S.gb/2921987‑2922051

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑