Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3055232	3055259	28	48 [0]	[2] 23	ygfA	predicted ligase

AGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGT  >  W3110S.gb/3055167‑3055231                                                                 | aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:393/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1094572/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:2381247/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:241148/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:2473882/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:2504470/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:278328/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:292078/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:302282/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:351914/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:370797/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:2372868/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:402014/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:412636/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:605918/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:677365/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:717742/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:926075/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:929638/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:968304/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:982153/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:982280/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:141160/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1096862/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1100436/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:110398/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1113448/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1179956/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1304559/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1324828/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1387549/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:2110394/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1419028/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1474303/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1522979/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1557539/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1570466/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1612526/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1667386/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1814823/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1953107/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:208966/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGAAGt  <  1:2235/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTACACGt  <  1:499128/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCACGATTAGACGt  <  1:142972/65‑1 (MQ=255) aGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGAGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:1383679/65‑1 (MQ=255)  ggTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:517402/64‑1 (MQ=255)      gAAGATCCATGAGCGAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGt  <  1:758898/60‑1 (MQ=255)                                                                 | AGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGT  >  W3110S.gb/3055167‑3055231

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑