Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3089440	3089442	3	42 [0]	[0] 7	endA	DNA‑specific endonuclease I

TCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAGG  >  W3110S.gb/3089375‑3089439                                                                 | tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:572974/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:2502474/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:26516/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:280059/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:298163/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:331380/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:373037/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:390581/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:513324/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:549844/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1146952/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:586367/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:597181/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:646250/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:653168/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:708544/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:827703/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:866496/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:88360/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:88454/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1831925/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1052255/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1180430/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1192581/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1253068/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1311011/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1374857/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1711748/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1784424/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:2270871/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1847911/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1884435/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1886290/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1917122/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1942825/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:2045226/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:2090576/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:2150669/65‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTGAGGTCAATGGCGCTCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:2327909/65‑1 (MQ=255)  cAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1800149/64‑1 (MQ=255)     tCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:274772/61‑1 (MQ=255)                            ggCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAgg  <  1:1489468/38‑1 (MQ=255)                                                                 | TCAGTCGGTGAGGTGAATGGCGATCGCGGCAACTTTATGTACAGCCAGTGGAATGGCGGTGAAGG  >  W3110S.gb/3089375‑3089439

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑