Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3092181	3092277	97	22 [0]	[0] 20	yqgF	predicted Holliday junction resolvase

TGGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCG  >  W3110S.gb/3092116‑3092180                                                                 | tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:2332087/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:980988/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:925839/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:861053/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:708316/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:58403/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:253127/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:2507791/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:2455543/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:2450939/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:2373939/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:1053329/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:2263607/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:2193206/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:197654/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:16065/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:1542756/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:1515329/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:1506425/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:1395010/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:1391391/1‑65 (MQ=255) tgGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCg  >  1:1175572/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TGGATATTCTCACCATGCCTGGTGTGGCAGGACACGCCTGATGAGTGGAACCTTACTCGCCTTCG  >  W3110S.gb/3092116‑3092180

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑