Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3110323	3110351	29	28 [0]	[0] 29	yghE	ECK2964:JW5924:b2969; predicted secretion pathway protein, L‑type protein

TTCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAG  >  W3110S.gb/3110260‑3110322                                                               | ttCGGTAGCTGACGCTAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1152264/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2071548/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:90436/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:837048/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:608110/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:505840/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:325134/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2442838/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2381289/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2278306/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2203111/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2123532/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:100485/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1927566/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:19167/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:189029/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:168288/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1676165/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1659430/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1444240/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1296535/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1219191/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1072853/63‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCATCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1645327/63‑1 (MQ=255)    ggTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2094372/60‑1 (MQ=255)              gcgAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:1242478/50‑1 (MQ=255)                gAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:2501871/48‑1 (MQ=255)                            gCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAg  <  1:410631/36‑1 (MQ=255)                                                               | TTCGGTAGCTGACGCGAGGCTGCCACGGCCCTGTCAGCAGGTTCCCTTCCGGTTCGCCATAAG  >  W3110S.gb/3110260‑3110322

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑