Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3110818	3110820	3	36 [0]	[0] 4	yghF	predicted secretion pathway protein, C‑type protein

AGCGCGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGA  >  W3110S.gb/3110753‑3110817                                                                 | agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAATACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:761390/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAATTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2105651/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:368325/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2304276/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2334526/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2366206/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:258566/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:282910/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:288470/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:306832/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2302794/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:515082/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:740987/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:82361/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:838318/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:930371/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:960222/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1300302/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2138818/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2123306/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1917554/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1845127/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1807235/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1746695/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2264921/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1564792/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:153921/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1487009/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1484413/65‑1 (MQ=255) agcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTAGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1438469/65‑1 (MQ=255)  gcgcTATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTTCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:2258209/64‑1 (MQ=255)  gcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1712294/64‑1 (MQ=255)  gcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:917955/64‑1 (MQ=255)  gcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:507698/64‑1 (MQ=255)  gcgcGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1109673/64‑1 (MQ=255)   cgcgATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGa  <  1:1438257/63‑1 (MQ=255)                                                                 | AGCGCGATGGAAATGTCGTGGCGCGCACCCTTGCGTAAAACCGTAAGTTGAATGGAATCCATTGA  >  W3110S.gb/3110753‑3110817

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑