Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3115993	3116010	18	26 [0]	[0] 13	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

CGTCGGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAG  >  W3110S.gb/3115929‑3115992                                                                | cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTTAg  <  1:323629/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2409212/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:953178/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:752712/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:718936/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:358069/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:311608/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2513877/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2493084/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:245950/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:1115905/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2324725/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2317775/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2200982/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:1914603/64‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:1871336/64‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2371603/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2160824/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2093520/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:293458/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:2015414/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:1893286/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:438123/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:1448050/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:91822/63‑1 (MQ=255)  gtcgGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAg  <  1:1382331/63‑1 (MQ=255)                                                                | CGTCGGACAGATAGCGCAGCACGTTCTCCATGAAGTTCTTCATGTCATCCGGGTCGCTGTTGAG  >  W3110S.gb/3115929‑3115992

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑