Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3158366	3158381	16	20 [0]	[0] 41	ygiQ	conserved hypothetical protein

GCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACG  >  W3110S.gb/3158301‑3158365                                                                 | gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:2473117/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:919543/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:875584/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:689621/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:665023/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:635177/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:632326/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:603764/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:402556/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:1088265/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:2212327/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:2138163/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:2103617/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:172094/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:1631724/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:1628745/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:1351960/65‑1 (MQ=255) gCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:1117803/65‑1 (MQ=255)  cTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:1973179/64‑1 (MQ=255)    aTGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACg  <  1:638215/62‑1 (MQ=255)                                                                 | GCTATGTCATAACGCACACCAGAGGCAATCAGGATCTTTTTAATGCCTTTCAGATCACGCGCACG  >  W3110S.gb/3158301‑3158365

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑