Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3169826	3169835	10	33 [0]	[0] 25	qseC	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with QseB

CGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCG  >  W3110S.gb/3169763‑3169825                                                               | cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:2197876/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:985606/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:960854/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:914046/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:883941/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:675911/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:477995/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:468144/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:432724/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:2528010/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:2515308/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:2343029/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:228164/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:2229395/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:2206764/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1022291/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1702106/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1052854/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:114226/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:116821/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1197516/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1240277/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1283553/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1303742/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:148321/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1494252/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1621304/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1639558/63‑1 (MQ=255) cgcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1657564/63‑1 (MQ=255)  gcgACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:266489/62‑1 (MQ=255)                     aaGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTGGCCCg  <  1:1803766/43‑1 (MQ=255)                     aaGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:414011/43‑1 (MQ=255)                      aGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCg  <  1:1636667/42‑1 (MQ=255)                                                               | CGCGACTGGCGTACCCAGCGAAGTGCGGCCACTGGTTGAGTCGCTAAATCAACTGTTCGCCCG  >  W3110S.gb/3169763‑3169825

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑