Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3178728	3178806	79	22 [0]	[0] 11	ygiB	conserved outer membrane protein

TTGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGAAA  >  W3110S.gb/3178665‑3178727                                                               | ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2178081/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:770003/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:753800/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:736350/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:711677/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:44237/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:311427/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:302996/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2524566/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2315203/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2293476/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:1097131/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2160770/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2138874/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2098207/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:2092787/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:1858690/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:1781060/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:1714257/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:1665494/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:1335813/1‑63 (MQ=255) ttGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGaaa  >  1:1223090/1‑63 (MQ=255)                                                               | TTGCTGAATTTGGTGAAGGTCAGTGCCAGCAGGCACCAGCCCAGGCTGGCATGGCACCAGAAA  >  W3110S.gb/3178665‑3178727

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑