Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3211731	3211753	23	10 [0]	[0] 32	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

AACACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGA  >  W3110S.gb/3211666‑3211730                                                                 | aaCACCAACCTCATGAAATAATTGTGGATACCGTCTTATTGAGCAAAACCCGCAGTCACATCTGa  <  1:30103/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:1062545/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:1162462/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:1681844/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:1698840/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:2016480/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:2366768/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:385681/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:699997/65‑1 (MQ=255) aaCACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGa  <  1:722106/65‑1 (MQ=255)                                                                 | AACACCAACCTCATGAAATAAGTGTGGATACCGTCTTATGGAGCAAAACCCGCAGTCACAGCTGA  >  W3110S.gb/3211666‑3211730

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑