Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3237632	3237636	5	26 [0]	[0] 53	alx	predicted inner membrane protein, part of terminus

CGCCGCGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACT  >  W3110S.gb/3237569‑3237631                                                               | cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:2245476/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:869737/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:851100/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:832480/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:811538/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:776141/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:744505/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:71270/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:542543/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:446672/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:2513676/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:2509750/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:2255655/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1255061/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:2228125/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:2221528/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:2169965/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1997788/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1939162/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1855376/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1724194/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1653139/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1547323/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1465454/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACt  >  1:1437535/1‑63 (MQ=255) cgccgcGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCATCACt  >  1:2174945/1‑63 (MQ=255)                                                               | CGCCGCGTGCTGGTGTATGGCGTGCTCGGGGCGATTGTTCTGCGTACCATCATGATCTTCACT  >  W3110S.gb/3237569‑3237631

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑