Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3246285	3246289	5	64 [0]	[0] 24	exuR/yqjA	DNA‑binding transcriptional repressor/conserved inner membrane protein

TTTGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATG  >  W3110S.gb/3246220‑3246284                                                                 | tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:497007/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1015321/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2434928/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2437292/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2441046/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2528471/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2528473/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:265119/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:278491/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:336911/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:368027/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:368316/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:387574/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:390245/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:391309/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:495000/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:243352/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:534969/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:561959/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:626594/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:651249/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:678331/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:699538/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:708306/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:792861/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:86407/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:871249/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:935657/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:940838/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:941960/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:947876/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:992367/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1849781/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1050625/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1058469/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1075211/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1270239/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1405774/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1409652/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1422608/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1502799/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1593175/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1596907/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1597732/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1702678/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1748481/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1748823/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1779598/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1874432/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:1898021/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2086058/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2150964/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2222034/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2236251/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2256263/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2264890/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2279776/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2285523/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2291081/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:23150/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2315903/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTGTTTGAATg  >  1:2300476/1‑65 (MQ=255) tttGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTCATGTTTTTGAATg  >  1:43145/1‑65 (MQ=255) tttGATAACCAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATg  >  1:2423082/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTTGATAACGAACAACGTTGACCTTTGTTACAATTAGATTCAATTTGAATTTATGTTTTTGAATG  >  W3110S.gb/3246220‑3246284

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑