Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3288447	3288465	19	18 [0]	[0] 17	yraI	predicted periplasmic pilin chaperone

ACGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAATATATATA  >  W3110S.gb/3288382‑3288446                                                                 | aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:2451687/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:679025/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:620192/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:604597/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:52971/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:418291/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:369714/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:364850/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:1278188/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:2328778/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:2170767/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:2016503/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:2013895/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:1877674/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:1848049/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:173552/65‑1 (MQ=255) aCGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:1471366/65‑1 (MQ=255)       aaaCGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAAtatatata  <  1:393651/59‑1 (MQ=255)                                                                 | ACGGGTAAACGATGCGTGGAAATCACTGGAATTTAAACGTAGTGACCATTCACTCAATATATATA  >  W3110S.gb/3288382‑3288446

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑