Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3348832	3348882	51	41 [0]	[0] 5	yrbL	hypothetical protein

TTGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAAGAG  >  W3110S.gb/3348767‑3348831                                                                 | ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAggag  <  1:1141313/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:420257/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1866381/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1921044/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:2033582/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:2139089/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:2199761/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:2215250/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:2236674/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:2500015/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:2500480/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:272155/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1857624/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:506466/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:592771/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:603194/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:623306/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:720286/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:785751/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:81315/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:889129/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1171655/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1064610/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1068690/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1081483/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1145469/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1162482/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1165008/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1224713/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1349115/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1473047/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1652757/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1700446/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:17248/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1726123/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1809907/65‑1 (MQ=255) ttGGTGAAAGCACATTGATTACACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1145380/65‑1 (MQ=255)  tGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:473953/64‑1 (MQ=255)   ggTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1407717/63‑1 (MQ=255)    gTGAAAGAACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTTGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1092551/62‑1 (MQ=255)                              aCCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAagag  <  1:1004362/36‑1 (MQ=255)                                                                 | TTGGTGAAAGCACATTGATTCCACTGGCGACCTGGTCGAAGTGGTGTTGTCTGCGTAAGCAAGAG  >  W3110S.gb/3348767‑3348831

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑