Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3351162	3351177	16	24 [0]	[0] 5	arcB	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ArcA

TAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCAA  >  W3110S.gb/3351097‑3351161                                                                 | tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1790607/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2474201/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2408664/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2384109/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2315445/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2302293/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2257785/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2146517/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2053865/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1809553/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:2520557/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1532287/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:756568/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1253057/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1179111/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGCTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:789347/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTCAGTGCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1616346/65‑1 (MQ=255) tAACGTTTCGTAAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:61832/65‑1 (MQ=255)  aaCGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1183043/64‑1 (MQ=255)  aaCGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1670305/64‑1 (MQ=255)  aaCGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1521183/64‑1 (MQ=255)  aaCGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1496920/64‑1 (MQ=255)  aaCGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:1241159/64‑1 (MQ=255)          gTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCaa  <  1:997806/56‑1 (MQ=255)                                                                 | TAACGTTTCGTCAGTTCACGAGAGATATCCAGCCCGGTCATATCTGGCAACTGAATATCCAGCAA  >  W3110S.gb/3351097‑3351161

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑