Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3360304 3360349 46 8 [0] [0] 12 gltD glutamate synthase, 4Fe‑4S protein, small subunit

CATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAT  >  W3110S.gb/3360240‑3360303
                                                               |
cATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:1070005/64‑1 (MQ=255)
cATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:119213/64‑1 (MQ=255)
cATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:1199777/64‑1 (MQ=255)
cATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:1379329/64‑1 (MQ=255)
cATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:2058943/64‑1 (MQ=255)
cATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:423178/64‑1 (MQ=255)
cATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:888209/64‑1 (MQ=255)
 aTGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAt  <  1:1003477/63‑1 (MQ=255)
                                                               |
CATGGCGTTTGGTTTCCGTCCACACAACATGGAATGGCTGGCAAAACACAGCGTCGAGCTGGAT  >  W3110S.gb/3360240‑3360303

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: