Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3416982	3416984	3	9 [0]	[0] 7	acrF	multidrug efflux system protein

CGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGT  >  W3110S.gb/3416917‑3416981                                                                 | cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:1057641/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:1469435/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:1672533/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:1768500/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:2376645/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:310599/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:89698/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGt  >  1:933447/1‑65 (MQ=255) cGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCAAGGCCCGt  >  1:906104/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGGGTTTCGACTTTGAGTTAATTGATCAGGCTGGGCTGGGTCACGATGCCCTAACCCAGGCCCGT  >  W3110S.gb/3416917‑3416981

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑