Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3496026	3496037	12	14 [0]	[0] 28	ptsA	fused predicted PTS enzymes Hpr component, enzyme I component, and enzyme IIA component

GATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCAAA  >  W3110S.gb/3495962‑3496025                                                                | gATCCCGATGATCTCCTCGATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:1514672/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:1068389/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:1229580/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:145051/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:1486496/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:1684464/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:1898006/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:2136564/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:2394895/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:2468263/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:321066/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:508206/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:550401/64‑1 (MQ=255) gATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCaaa  <  1:589826/64‑1 (MQ=255)                                                                | GATCCCGATGATCTCCTCAATGGAAGAGATCTTATGGGTGAAAGAAAAACTGGCGGAAGCCAAA  >  W3110S.gb/3495962‑3496025

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑