Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3496819	3496839	21	24 [0]	[0] 7	ptsA	fused predicted PTS enzymes Hpr component, enzyme I component, and enzyme IIA component

TGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGAACA  >  W3110S.gb/3496756‑3496818                                                               | tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGTCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1463421/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1814215/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:905096/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:898096/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:684132/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:607648/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:58939/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:2337494/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:2237331/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:2002383/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1965543/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1865244/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1008087/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1618736/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1548893/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1535726/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1481059/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1427214/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1420864/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1419794/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1340261/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1261367/63‑1 (MQ=255) tGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:1066983/63‑1 (MQ=255)                            atgaAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGaaca  <  1:2029236/36‑1 (MQ=255)                                                               | TGCAAGCGCCGGTGCGCTGGGGCGATGATGAAGCGCAATTCATCATTATGTTAACCCTGAACA  >  W3110S.gb/3496756‑3496818

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑