Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3502054	3502105	52	23 [0]	[0] 21	katG	catalase/hydroperoxidase HPI(I)

TTCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGACCAC  >  W3110S.gb/3501989‑3502053                                                                 | ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1961508/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:951398/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:756993/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:674453/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:650574/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:611186/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:609105/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:539255/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:402332/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:212558/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1086946/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1865305/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:16465/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1478537/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1343026/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1302872/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1263494/65‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1176198/65‑1 (MQ=255) ctCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1907453/64‑1 (MQ=255)  tCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1889288/64‑1 (MQ=255)  tCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:435824/64‑1 (MQ=255)  tCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:673948/64‑1 (MQ=255)            gACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGaccac  <  1:1709521/54‑1 (MQ=255)                                                                 | TTCTGGATCAGGACCTACATTTGATGTCGGACCGGCACCGTGGGTTTTACCCAGCGTATGACCAC  >  W3110S.gb/3501989‑3502053

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑