Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3524025	3524047	23	26 [0]	[1] 9	yiiR	conserved inner membrane protein

CATCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAT  >  W3110S.gb/3523961‑3524024                                                                | caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:248626/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:874726/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:795551/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:792694/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:783670/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:773471/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:535756/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:525001/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:508193/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:49571/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:380318/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:26829/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:267644/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1224598/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:2268244/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:2209937/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:2041661/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1861207/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1551551/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1534385/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1510267/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1453634/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:132676/64‑1 (MQ=255) caTCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1272110/64‑1 (MQ=255)           aTCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:1722064/54‑1 (MQ=255)                 aCCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAt  <  1:176377/48‑1 (MQ=255)                                                                | CATCCTGAGTATCTTTACCATATTTATTTTCGCCTTGTGTGCCAACAAACGCACCAAGATCGAT  >  W3110S.gb/3523961‑3524024

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑