Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3541355	3541366	12	26 [0]	[0] 6	rhaA	L‑rhamnose isomerase

CTCGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTGC  >  W3110S.gb/3541290‑3541354                                                                 | ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:2358517/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:999270/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:970227/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:968248/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:925468/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:89304/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:834017/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:558264/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:275275/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:250078/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:2494181/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:2484079/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1101510/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:2199105/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:2097977/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1933543/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1869822/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1855872/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1455506/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1369556/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1185592/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1160907/65‑1 (MQ=255) ctcGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1112620/65‑1 (MQ=255)    gCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1725350/62‑1 (MQ=255)          cgTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGATGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:1841128/56‑1 (MQ=255)                      ctgGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTgc  <  1:616839/44‑1 (MQ=255)                                                                 | CTCGCCCCGCGTCAGCGTCTGCTGGCAGCACTGGATGAGGTGATCAGCGAGAAGCTAAACCCTGC  >  W3110S.gb/3541290‑3541354

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑