Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3618794	3618851	58	23 [0]	[1] 25	rmuC	predicted recombination limiting protein

TCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTG  >  W3110S.gb/3618729‑3618793                                                                 | tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1286772/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:957664/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:920701/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:693399/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:668547/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:654738/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:506438/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:474755/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:365073/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:2525689/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:249472/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:200015/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:195199/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1913152/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1781952/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1573517/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1552086/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1381253/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1340016/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1021830/65‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTAAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1820710/65‑1 (MQ=255)                        aTTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:198519/42‑1 (MQ=255)                        aTTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTg  <  1:1662305/42‑1 (MQ=255)                                                                 | TCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGCGCGTCAGGTTGATCGCTTCCTG  >  W3110S.gb/3618729‑3618793

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑