Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3717242	3717258	17	38 [0]	[0] 28	atpA	F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, alpha subunit

AAAGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACG  >  W3110S.gb/3717177‑3717241                                                                 | aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:685185/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1067409/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:2319977/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:240534/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:326390/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:343016/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:343994/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:357823/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:429472/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:668800/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:2206415/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:691800/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:72013/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:759058/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:782001/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:808501/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:912408/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:931599/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:979035/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1765350/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1076854/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1219299/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1264991/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1298029/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1372227/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1436352/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1505175/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1511867/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1706529/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:2131359/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1925941/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1934585/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1995506/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:2014807/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:2066713/65‑1 (MQ=255) aaaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:2100334/65‑1 (MQ=255)  aaGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:2498773/64‑1 (MQ=255)   aGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACg  <  1:1870640/63‑1 (MQ=255)                                                                 | AAAGGTCCGCTGGATCACGACGGCTTCTCTGCTGTAGAAGCAATCGCTCCGGGCGTTATCGAACG  >  W3110S.gb/3717177‑3717241

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑