Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3738090	3738100	11	34 [0]	[0] 11	cbrC	conserved hypothetical protein

GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCACCC  >  W3110S.gb/3738027‑3738089                                                               | gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:498007/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2117532/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2136219/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2305693/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2311199/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2379245/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2523171/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2526835/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:397985/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2066719/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:609179/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:617922/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:733408/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:737561/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:746794/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:838644/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:934683/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1408207/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1117843/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1117965/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1176860/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1192265/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1206425/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1230676/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1272474/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1087457/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1421766/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1441939/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1580639/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1800356/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1881480/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2021396/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:2048021/1‑63 (MQ=255) gCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTCCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCAccc  >  1:1141485/1‑63 (MQ=255)                                                               | GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTGTTCTCATTATTTAAATAACTACGAAAAATCACCC  >  W3110S.gb/3738027‑3738089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑