Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3771362	3771375	14	29 [0]	[0] 6	yidR	conserved hypothetical protein

GAGGTTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCAGA  >  W3110S.gb/3771297‑3771361                                                                 | gaggtTATCTATCGCGCGTCATAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1857115/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1988975/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:99420/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:97231/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:96483/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:89100/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:78733/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:725263/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:492312/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:478060/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:397008/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:267008/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:265611/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:2527244/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:2474812/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:2262819/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1012736/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1978453/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1950340/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1812778/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1666750/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1374922/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1366583/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1341599/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1319488/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1283146/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1147938/65‑1 (MQ=255) gaggtTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1054856/65‑1 (MQ=255)                          gcgcACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCaga  <  1:1376909/40‑1 (MQ=255)                                                                 | GAGGTTATCTATCGCGCGTCACAGGGCGCACACGTCGGCGTGGTGACCGTTCATCCGAAGTCAGA  >  W3110S.gb/3771297‑3771361

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑