Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3778224	3778283	60	29 [0]	[0] 31	glvB	arbutin specific enzyme IIB component of PTS

AGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGCGCG  >  W3110S.gb/3778159‑3778223                                                                 | aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1872124/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:985061/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:944178/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:89375/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:78053/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:561933/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:53707/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:391970/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:2499609/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:2454335/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:2450527/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:234576/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:2240009/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:2112369/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:2056832/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1174643/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1850123/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1838401/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1760193/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:169012/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1628369/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1610244/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1593401/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1531329/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:145401/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1442155/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1428983/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1298775/1‑65 (MQ=255) aGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGcgcg  >  1:1211155/1‑65 (MQ=255)                                                                 | AGGCTGCCGGTATCCTGCAAGCCCTGGGCGGGGTCGGCAATATCTCCAGCATTAACAATTGCGCG  >  W3110S.gb/3778159‑3778223

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑