Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3784470	3784475	6	29 [0]	[0] 16	yidG	predicted inner membrane protein

ATTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAG  >  W3110S.gb/3784406‑3784469                                                                | atTGATGGTCGTGGCGGTTATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1436351/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:952209/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:443357/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:429271/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:412366/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:408145/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:571146/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:247350/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:2410517/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:2407182/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:2300350/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:712497/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:2188862/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:21241/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1951983/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1922790/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1884772/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:179449/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1780834/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1627407/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1546917/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1451897/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1407097/64‑1 (MQ=255) atTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1341731/64‑1 (MQ=255)  ttGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:985508/63‑1 (MQ=255)  ttGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:222945/63‑1 (MQ=255)  ttGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:2081450/63‑1 (MQ=255)  ttGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:1385741/63‑1 (MQ=255)    gATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAg  <  1:371919/61‑1 (MQ=255)                                                                | ATTGATGGTCGTGGCGGTGATCGTTATGGGACTGGTGTTGTATGCCGGATAGCCGCAAAGCCAG  >  W3110S.gb/3784406‑3784469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑