Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3802877	3802894	18	14 [0]	[0] 6	setC	predicted sugar efflux system

TATCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTG  >  W3110S.gb/3802810‑3802876                                                                   | tATCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACG‑‑AGGAATATTTCTTTg  <  1:488312/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTTGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:856168/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:1006721/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:1974988/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:1977857/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:2055454/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:2201371/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:2453782/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:338787/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:370790/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:405329/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:979875/65‑1 (MQ=255)   tCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGGTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:2267339/65‑1 (MQ=255)    cccGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTg  <  1:2510914/64‑1 (MQ=255)                                                                   | TATCCCGCTTCCTGTGGGTGGAGGGTAAAATTTCTACGGGTTGGGTAACGACAGGAATATTTCTTTG  >  W3110S.gb/3802810‑3802876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑