Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3817642	3817646	5	19 [0]	[0] 10	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

CAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCA  >  W3110S.gb/3817577‑3817641                                                                 | cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACTGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:2206262/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCATGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:451783/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:917966/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:891583/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1450470/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1613727/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:857962/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1829692/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1915264/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1930239/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1102216/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:794466/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:2305573/65‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:248190/65‑1 (MQ=255)  aGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:2005272/64‑1 (MQ=255)  aGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:2193366/64‑1 (MQ=255)  aGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1767511/64‑1 (MQ=255)  aGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1361085/64‑1 (MQ=255)   gCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCa  <  1:1411632/63‑1 (MQ=255)                                                                 | CAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCACCA  >  W3110S.gb/3817577‑3817641

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑