Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3821347	3821427	81	40 [0]	[0] 4	yicG	conserved inner membrane protein

CTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATA  >  W3110S.gb/3821282‑3821346                                                                 | cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGTTAGCGACGATa  <  1:116346/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:546525/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2148583/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2234209/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2348625/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2403333/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2484354/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2527334/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:260289/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:414798/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:53473/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:536004/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2094887/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:549009/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:563645/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:686599/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:724940/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:779392/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:79102/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:825661/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:854297/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1583883/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1045633/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1078805/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1174100/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1242201/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1295833/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1359076/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1423822/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1509144/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1514395/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1015645/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1611198/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1647731/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1689217/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1872272/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1873631/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1896027/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:1911442/65‑1 (MQ=255) cTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATa  <  1:2007373/65‑1 (MQ=255)                                                                 | CTTTGCGCAGGTAAGGCATTACAGGAGCAACGATAGTGGTGAGTACTGCGGCGGTAGCGACGATA  >  W3110S.gb/3821282‑3821346

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑