Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3871312	3871318	7	16 [0]	[0] 40	yibH/yibG	hypothetical protein/conserved hypothetical protein

AACCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGAA  >  W3110S.gb/3871247‑3871311                                                                 | aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:1019729/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:1157954/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:1348350/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:1646069/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:1651601/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:2071143/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:230116/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:2346359/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:2383544/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:368261/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:37356/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:377435/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:541985/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:808424/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGaa  >  1:914334/1‑65 (MQ=255) aaCCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGAATTGaa  >  1:1235093/1‑65 (MQ=255)                                                                 | AACCCTCGGAACAGAATCGAGGTCCTAAAGACGGACCAAAAGCGTTTAAACAACTATGTATTGAA  >  W3110S.gb/3871247‑3871311

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑