Missing coverage evidence...
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GACGATTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTGG  >  W3110S.gb/3885084‑3885148                                                                 | gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:236463/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:878177/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:868031/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:811021/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:769274/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:573935/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:571426/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:535/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:491435/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:489630/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:451411/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:420626/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:358462/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:345780/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:343983/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1049266/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1551817/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1193133/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1195957/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1241173/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1326788/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1410936/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1485232/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:2236121/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1553774/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1583583/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1702215/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1924424/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:2148982/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGCTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTTCTgg  <  1:720489/65‑1 (MQ=255) gacgaTTCTGTTTGGGCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:2118011/65‑1 (MQ=255)  acgaTTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:1859926/64‑1 (MQ=255)                          atGCGTGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTgg  <  1:707428/40‑1 (MQ=255)                                                                 | GACGATTCTGTTTGGTCAGAACAATATGCGGGTGTTCCAGGAGGAGATTTTTGGCCCGGTGCTGG  >  W3110S.gb/3885084‑3885148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑