Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3986607	3986616	10	46 [0]	[0] 22	slp/insH	outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator

GTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCG  >  W3110S.gb/3986542‑3986606                                                                 | gttaCGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1595959/62‑1 (MQ=255) gcaaCGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:572994/63‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATTCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:497945/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:587658/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1249572/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2378492/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2499301/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2500025/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:27622/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:324840/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:385206/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:43365/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:514785/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2312779/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:644588/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:653817/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:729805/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:773365/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:831309/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:883110/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:925409/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:960397/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:965353/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1620548/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1348020/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1383301/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:13949/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1399294/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1402196/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1419195/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1512077/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1586180/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1602434/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1616131/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2245067/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:16880/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:169988/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:189221/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:190839/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1932698/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:1976827/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2085205/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2135690/65‑1 (MQ=255) gTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:2191111/65‑1 (MQ=255)  tAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:935603/64‑1 (MQ=255)                  gATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCg  <  1:561603/48‑1 (MQ=255)                                                                 | GTAACGTAAACCTGTCTGATGTTTATATCCTTTCTGTTTAGGTGAACTCAGTTAATTTTGGGGCG  >  W3110S.gb/3986542‑3986606

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑