Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4017612–4017628	4017692	65–81	18 [0]	[0] 23	rhsB	rhsB element core protein RshB

CCTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCGG  >  W3110S.gb/4017547‑4017611                                                                 | ccTTCAGTCCAATCTGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:1709747/65‑1 (MQ=255) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:2226698/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:984780/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:681738/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:676354/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:45750/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:2504756/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:2483775/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:2448546/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:2229144/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:1081917/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:221814/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:2178964/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:2083497/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:1978348/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:1895856/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:1804466/65‑1 (MQ=39) ccTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCgg  <  1:127983/65‑1 (MQ=39)                                                                 | CCTTCAGTCCAATCGGATCCTGAGTGATATATCGCCCCTGCAGCGGGTCATAATAGCGGTGGCGG  >  W3110S.gb/4017547‑4017611

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑