Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4021524	4021554	31	23 [0]	[0] 27	nikR	DNA‑binding transcriptional regulator, Ni‑binding

CGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCACC  >  W3110S.gb/4021460‑4021523                                                                | cGTGCCGCTCGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1526966/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1986927/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:772503/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:46064/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:318309/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2518215/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2434307/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2332649/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2240373/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2230331/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2127747/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2111327/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:2104225/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1085608/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1947936/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1925587/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1682727/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1570951/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1334857/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1331133/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1221201/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1218995/64‑1 (MQ=255) cGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCAcc  <  1:1145118/64‑1 (MQ=255)                                                                | CGTGCCGCACGCCGCGCTGGGCGATAACGTCATCGGCAAAATGCTGCACGTCACCCATGTCACC  >  W3110S.gb/4021460‑4021523

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑