Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4039884	4039930	47	9 [0]	[0] 12	rpoH	RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor

CATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACA  >  W3110S.gb/4039820‑4039883                                                                | cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:1252133/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:1252478/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:1278407/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:1675181/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:1774085/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:2361586/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:2467772/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:91899/64‑1 (MQ=255) cATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACa  <  1:966622/64‑1 (MQ=255)                                                                | CATATTGCTCGTAATTATGCGGGCTATGGCCTGCCACAGGCGGATTTGATTCAGGAAGGTAACA  >  W3110S.gb/4039820‑4039883

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑