Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4084914	4084981	68	57 [0]	[0] 13	malT	DNA‑binding transcriptional activator, maltotriose‑ATP‑binding

CAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGC  >  W3110S.gb/4084849‑4084913                                                                 | cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2368398/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1645337/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1666122/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1669145/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1686767/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1706408/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1847006/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1877835/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1998654/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2290986/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2341440/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1703488/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:242287/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2518758/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:291427/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:336967/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:430909/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:464891/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:586850/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:764651/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:868048/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:919291/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1411662/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1182179/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1177005/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1168595/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1610263/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1309141/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1168466/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1144954/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1132615/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1106263/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1532411/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1098635/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1536796/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1583101/65‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1054599/65‑1 (MQ=255)  aGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:54194/64‑1 (MQ=255)  aGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2326270/64‑1 (MQ=255)      aCTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:655177/60‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1272740/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:666854/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1065746/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2401160/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2382007/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1222222/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2225165/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2092776/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1437739/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1503148/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1023393/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1536232/57‑1 (MQ=255)         tCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1603230/57‑1 (MQ=255)           aGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:429030/55‑1 (MQ=255)           aGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:1636978/55‑1 (MQ=255)                       cAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2215203/43‑1 (MQ=255)                            gTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGc  <  1:2246299/38‑1 (MQ=255)                                                                 | CAGGTACTTCAGGATGATTTAGCAGACGTTCAACGAAATTCTCATCGAAATGGGCGAATTTATGC  >  W3110S.gb/4084849‑4084913

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑