Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4105167	4105233	67	24 [0]	[0] 15	envZ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with OmpR

CCGTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCG  >  W3110S.gb/4105102‑4105166                                                                 | ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1438932/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:721911/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:71253/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:660857/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:436370/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:404172/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:333852/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:328010/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:324418/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:317238/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:2517287/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:2286697/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:207918/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:2036216/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1974198/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1885253/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1803858/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1798565/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1782047/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1534718/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1484471/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1456781/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:1220914/65‑1 (MQ=255) ccgTTGGTCGATCTCCAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCg  <  1:835266/65‑1 (MQ=255)                                                                 | CCGTTGGTCGATCTCGAACACGCAGCCTTGCAGGTTGGTAAAGGGATTATTCCGCCGCCGCTGCG  >  W3110S.gb/4105102‑4105166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑