Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4118189	4118227	39	31 [0]	[0] 19	yrfD	predicted pilus assembly protein

TGTGAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCTCAT  >  W3110S.gb/4118125‑4118188                                                                | tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2232683/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:976603/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:640929/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:556747/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:539711/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:499539/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:483015/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:46049/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:382140/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:338905/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2510913/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2285044/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2259949/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2240387/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:121065/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2178532/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2162339/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:2103164/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1974792/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1966497/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1862165/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1824048/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1771646/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:169508/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1649730/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1622843/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1588603/64‑1 (MQ=255) tgtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1240862/64‑1 (MQ=255)  gtgAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:871784/63‑1 (MQ=255)             cACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:973968/52‑1 (MQ=255)                             gCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCtcat  <  1:1781619/36‑1 (MQ=255)                                                                | TGTGAGCGCGATCACCCCGGATGCCAGTGCATTACAGCGATTCCTGCCTTTTTTACCTTCTCAT  >  W3110S.gb/4118125‑4118188

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑