Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4120654	4120665	12	24 [0]	[0] 15	hofQ	predicted fimbrial transporter

CGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACAAAAA  >  W3110S.gb/4120589‑4120653                                                                 | cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:2231057/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:985991/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:975686/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:638789/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:544631/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:524438/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:49622/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:315520/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:312275/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:276949/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:2263014/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:117988/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:2095706/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:2065566/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:2022089/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:1827193/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:1730598/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:169388/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:1610631/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:1583551/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:1566920/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:1388054/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:1340432/1‑65 (MQ=255) cgACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGAGGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACaaaaa  >  1:2508677/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGACGTCGGTGGAATTTAAAGAGGCCGTCCTGGGGATGGAGGTCACGCCCACGGTGTTACAAAAA  >  W3110S.gb/4120589‑4120653

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑