Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4153309	4153351	43	44 [0]	[0] 6	yhfK	conserved inner membrane protein

ACTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCT  >  W3110S.gb/4153244‑4153308                                                                 | aCTGAGTGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2235402/65‑1 (MQ=255) aCTGAGTGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1745483/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:441113/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1024923/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2291767/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2448823/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2451539/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2470899/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:276025/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:298079/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:33037/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2189912/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:471961/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:535624/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:564068/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:593237/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:657399/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:812578/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:883170/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:899135/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:953458/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:990299/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2128238/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1056331/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1388558/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:146125/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1540207/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:154072/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1561170/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1621208/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1623319/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1663096/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:178884/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1843447/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1932322/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1946943/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2023421/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2075591/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTCCAATGGCCCCAGCt  <  1:1755973/65‑1 (MQ=255) aCTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGAGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2141550/65‑1 (MQ=255)  cTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:98657/64‑1 (MQ=255)  cTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1026600/64‑1 (MQ=255)       ggTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:1115395/59‑1 (MQ=255)         tAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCt  <  1:2254334/57‑1 (MQ=255)                                                                 | ACTGAGGGTAAAAATGGCGGCGAGCAGCGATGCAGGAAGCAATTTTGCGTGCAATGGCCCCAGCT  >  W3110S.gb/4153244‑4153308

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑