Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	309342	309359	18	34 [0]	[0] 11	yagZ	conserved hypothetical protein

GGGGGCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTA  >  W3110S.gb/309277‑309341                                                                 | gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:420100/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2312656/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2411752/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2426570/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2452802/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:265921/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:271397/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:36784/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:376738/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2240496/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:543732/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:547970/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:633925/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:711844/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:789524/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:857444/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:878150/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:181792/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1292825/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1303881/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1358596/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:161283/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1677746/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1695976/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1775799/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1776931/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1234614/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1866261/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1918711/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1978545/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:1993397/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2105433/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2126871/1‑65 (MQ=255) gggggCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTa  >  1:2180220/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GGGGGCTACCCCTGCTGGTACATCAGAGAGATTAACTGGTCCAGGTCGCGTCGAACTGTACGCTA  >  W3110S.gb/309277‑309341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑