Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4182908	4182965	58	43 [0]	[3] 26	gspD	general secretory pathway component, cryptic

CCATTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTAAA  >  W3110S.gb/4182843‑4182907                                                                 | ccaTTCTTTTTATAATCCGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1606302/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:265567/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:106140/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2208855/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2256833/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2298509/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2349614/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2362610/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2362964/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2491970/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:251796/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2542833/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:215643/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:330776/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:483967/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:589063/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:653703/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:772529/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:873148/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:888809/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:986223/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:166572/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:108592/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1291214/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1322199/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1338007/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:134463/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1427974/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1477209/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1503492/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1618590/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2021437/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1749141/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1763824/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1819438/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:186209/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1876414/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:189181/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1894501/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:1914528/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCAGGTATTTGTaaa  >  1:2227443/1‑65 (MQ=255) ccaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGCTAATCCGGTAATGGTaaa  >  1:637639/1‑65 (MQ=255) caaTTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTaaa  >  1:2303628/3‑65 (MQ=255)                                                                 | CCATTCTTTTTATAATCAGCCACACCTTGCGCAGCGTTAAAAATCGGTAATCCGGTATTGGTAAA  >  W3110S.gb/4182843‑4182907

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑