Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4186284	4186329	46	36 [0]	[0] 12	gspA	general secretory pathway component, cryptic

TACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAT  >  W3110S.gb/4186219‑4186283                                                                 | tACCTTTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1969765/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2356257/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:948145/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:888867/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:844166/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:841433/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:689863/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:663561/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:648331/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:61035/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:533393/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:440447/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:440246/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:336270/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2506036/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1096726/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1917668/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1110642/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1136024/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1284244/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1835448/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1943797/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2026652/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2059439/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2110058/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2114618/65‑1 (MQ=255) tACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCGGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1214701/65‑1 (MQ=255)  aCCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:47759/64‑1 (MQ=255)  aCCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:499427/64‑1 (MQ=255)  aCCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2132255/64‑1 (MQ=255)  aCCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:644767/64‑1 (MQ=255)  aCCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1914479/64‑1 (MQ=255)  aCCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:1760161/64‑1 (MQ=255)  aCCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2152902/64‑1 (MQ=255)                       gAGGAATAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:884639/43‑1 (MQ=255)                          gAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAt  <  1:2055602/40‑1 (MQ=255)                                                                 | TACCATTACGCGTGATAGCAGCGAGGAAGAGATTCTCTGGCTGGAAACGATGTTAAACCGCGCAT  >  W3110S.gb/4186219‑4186283

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑