Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4197126	4197148	23	44 [0]	[0] 6	secY	preprotein translocase membrane subunit

CTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAG  >  W3110S.gb/4197061‑4197125                                                                 | cTACGCGAAACGTCAGCGAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1172101/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2368895/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:993164/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2441799/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2450379/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2450818/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2476878/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2531674/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:356701/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:410603/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:426159/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:483118/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:632253/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:640924/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:66351/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:689035/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:701988/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:745804/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:873644/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:934134/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:950834/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:981096/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1156006/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1802623/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1243172/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1308304/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1323484/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1369624/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1420913/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1433288/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1500550/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1538771/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1645861/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:173589/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2302741/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1814884/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1901498/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:1911451/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2123055/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2141948/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2180109/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2247241/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2254088/65‑1 (MQ=255) cTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAg  <  1:2299301/65‑1 (MQ=255)                                                                 | CTACGCGAAACGTCAGCAAGGTCGTCGTGTCTATGCTGCACAGAGCACACATTTACCGCTGAAAG  >  W3110S.gb/4197061‑4197125

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑