Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4327450	4327470	21	35 [0]	[0] 26	phnE phnE	ECK4096:JW4064:b4103; phosphonate/organophosphate ester transporter phosphonate/organophosphate ester transporter subunit

CACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAAGCAG  >  W3110S.gb/4327386‑4327449                                                                | cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:644620/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2327124/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2340796/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2399959/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2530201/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:277126/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:477849/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:523532/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:614726/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2300217/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:655777/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:660354/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:669053/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:798439/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:832691/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:838433/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:911494/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:956499/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1549377/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1135987/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1175147/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1280012/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1337444/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1384288/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1507949/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1512190/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1018501/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1612943/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1737525/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1923070/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1976041/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2064847/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2104593/64‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:2152082/64‑1 (MQ=255)                          cgggccgggcTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAagcag  <  1:1424747/39‑1 (MQ=255)                                                                | CACCGGTGGCGCGAATGCCTTCCACCGGGCCGGGCTCAATCGCTTCCACCGCTTCGGAAAGCAG  >  W3110S.gb/4327386‑4327449

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑